近日,來自瑞士的科學家在國際著名生物學期刊nature medicine發表了他們的一項最新研究成果,他們結合壓力循環技術(PCT)和SWATH-MS技術提出一種將臨床組織樣本轉換為單個數字文件的方法,應用這種方法對樣本的蛋白組學信息進行記錄,方便研究人員對樣本信息進行反復分析和對比。這一方法的提出對增加臨床樣本的利用效率具有重要意義。
活體組織檢查(biopsy)簡稱"活檢",是指應診斷、治療的需要,從患者體內切取、鉗取或穿刺等取出病變組織,進行病理學檢查的技術。這是診斷病理學中最重要的部分,對絕大多數送檢病例都能做出明確的組織病理學診斷,被作為臨床的最后診斷。活檢取出的組織樣本一般量比較少,對于病人疾病的檢測和診斷非常重要。但每一個臨床樣本都具有其唯一性,樣本的量非常有限并且不可再生。類似于組織活檢這樣的小樣本經常會在一系列檢驗分析之后被消耗殆盡。
研究人員提出一種結合壓力循環技術(PCT)和SWATH-MS技術的方法,能夠將小量的組織樣本轉變成單個,永久性的數字文件,該類文件基于質譜技術,記錄著樣本的蛋白組學信息,并具有快速和可重復性特點。該方法導出的蛋白質組學圖譜文件能夠用于不同樣本之間特定蛋白質的分析,重分析,對比以進行檢測和量化。
研究人員應用這種方法將9名腎細胞癌病人的18個活檢樣本進行了處理并轉換成SWATH-MS片段離子圖譜。研究人員從所有樣本的蛋白質組學圖譜中檢測并量化了超過2000種蛋白,具有高度重復性。這些檢測出來的蛋白質清晰得將腎臟腫瘤組織與正常的健康組織區分開來,同時也對各種組織形態不同的腎臟腫瘤亞型進行了區分。
綜上所述,該項研究提出了將臨床樣本進行質譜處理分析轉換成數字文件的方法,增強了對臨床樣本的利用效率,具有非常重要的意義。