國家部分部委（局）、中國科學院、副部級以上國有大型企業根據行業發展也制定了重點實驗室管理制度，負責各行業重點實驗室的資質管理。如教育部重點實驗室、農業部重點實驗室、應急部重點實驗室、國家市場監督管理總局重點實驗室（工程中心）、國家藥品監督管理局重點實驗室、中科院重點實驗室、航空工業重點實驗室。

各省、自治區、直轄市的科技廳（委）、發展改革委根據科技部、國家發改委的實驗室管理序列，也各自制定管理制度，分別核定省級重點實驗室。各省科技廳制定管理辦法負責省重點實驗室、省工程研究中心評定管理，如《山東省重點實驗室管理辦法》《北京市重點實驗室認定與管理暫行辦法》《西藏自治區重點實驗室管理辦法》（暫行）。各省、自治區、直轄市發改委制定管理制度，評定省工程實驗室、省工程研究中心，如《山東省工程實驗室管理辦法（2018年修訂）》。

各省、自治區、直轄市其他廳局委也制定政策，評出自己業務范圍內的省級重點實驗室。如山東省教育廳重點實驗室。

政府授權的實驗室資質由市場監督管理部門及其他部分部委（局）或地方相應廳局依法依規評定并授權。

3.1.1市場管理部門授權的實驗室

市場監督管理部門負責以下五類實驗室資質許可：（一）為司法機關作出的裁決出具具有證明作用的數據、結果的；（二）為行政機關作出的行政決定出具具有證明作用的數據、結果的；（三）為仲裁機構作出的仲裁決定出具具有證明作用的數據、結果的；（四）為社會經濟、公益活動出具具有證明作用的數據、結果的；（五）其他法律法規規定應當取得資質認定的。資質認定依據原國家質檢總局頒發的《檢驗機構資質認定管理辦法》及相關標準。

市場監督管理總局負責國家產品質量中心的授權。主要依據《國家產品質量監督檢驗中心授權管理辦法》，依托法人單位授權國家質檢中心。國家對承擔政府部門組織實施的產品質量監督抽查中的產品質量檢驗、產品質量爭議仲裁檢驗等工作，并以國家產品質量監督檢驗中心的名義向社會出具具有證明作用的數據和結果的產品質量檢驗機構實行授權制度。

法定計量檢定機構授權。縣級以上人民政府計量行政部門可以根據需要，采取以下形式授權其他單位的計量檢定機構和技術機構，在規定的范圍內執行強制檢定和其他檢定、測試任務。授權專業性或區域性計量檢定機構，作為法定計量檢定機構；授權建立社會公用計量標準；授權某一部門或某一單位的計量檢定機構，對其內部使用的強制檢定計量器具執行強制檢定；授權有關技術機構，承擔法律規定的其他檢定、測試任務。

另外，對于強制性產品（3C）認證檢測的實驗室必須經國家市場監督管理局認證認可監督司考核認定。

3.1.2其他部委、地方局委認定的實驗室

法律特別規定的實驗室資質（包括產品型式試驗機構）認定，不能按照《檢驗機構資質認定管理辦法》要求由市場管理部門許可，而是由專門法律法規規定的相應部委授權。如軍隊管理部門負責從事軍隊校準、檢測的實驗室的許可，省級司法部門負責的司法檢定實驗室資質許可，藥品管理部門負責藥品檢驗機構資質認定。

3.2.1實驗室CNAS認可

國家認證認可委員會授權國家認證認可中心（CNAS）負責實驗室認可，包括：檢測和校準實驗室認可、醫學實驗室認可、醫學測量參考實驗室認可、能力驗證提供者認可、標準物質生產者認可、實驗室生物安全防護級別認可、實驗動物機構認可、科研實驗室認可。實驗室CNAS認可屬于自愿性認可，不具備對社會出具公證性證據的法律效力。是我國加入WTO的結果，可以提升市場競爭力。

3.2.2檢驗檢測機構資質認可

實驗室可以申請檢驗檢測機構認可資質，從事檢驗檢測業務。

國內實驗室可以向國外認可機構提出申請，由國外認可機構依據各自認可準則，經評定授予相應資質，此類資質只在授權許可的國外地區有效。如農業部蔬菜品質監督檢驗測試中心獲得國際種子協會認可實驗室，廣州廣電計量檢測股份有限公司（簡稱廣電計量）獲得美國船級社（ABS）船舶有害物質檢測機構認可。