傳統(tǒng)上,基于不同的細菌或真菌內蛋白組成分特別是核糖體蛋白有顯著的差異,對核糖體蛋白組的質譜測試,可用于快速、高準確度鑒定微生物?;|輔助激光解吸電離飛行時間質譜(MALDI-TOF MS,)亦因此應用,廣泛應用于歐美等發(fā)達國家以及我國的三甲醫(yī)院、省市級食品安全監(jiān)管機構等。結合了該方法的質譜在業(yè)內一般被稱為“微生物質譜”。限于傳統(tǒng)MALDI-TOF MS的性能局限,該方法未能利用更豐富的生物信息。
超4000種,生物組學微生物信息數(shù)據(jù)庫
微生物質譜可實現(xiàn)對已知微生物的鑒定,其鑒定核心之一為微生物數(shù)據(jù)庫容量。傳統(tǒng)的微生物數(shù)據(jù)庫建設方式為使用質譜儀采集經(jīng)過形態(tài)學或基因組學確認的已知微生物核糖體蛋白特征峰信息,并形成數(shù)據(jù)庫。該方法效率低、成本高,準確性難以保障。也因此,雖然地球上的微生物種類多達百萬種以上,但目前可用于微生物質譜鑒定的微生物只有數(shù)千種。
擁有先進科學儀器和生命科學背景的融智生物創(chuàng)新性地利用了新的微生物數(shù)據(jù)庫理念,改變了傳統(tǒng)的建庫流程,近期完成了QuanID微生物數(shù)據(jù)庫的建設。通過生物組學信息的結合,在獨特數(shù)據(jù)算法支持下,高效率地建設質譜鑒定微生物數(shù)據(jù)庫。截至目前,QuanID微生物數(shù)據(jù)庫已建成包含超過4000種微生物(細菌、真菌),涵蓋臨床、食品安全、畜牧獸醫(yī)、環(huán)境生態(tài)和科研等多個領域的巨大微生物質譜數(shù)據(jù)庫。經(jīng)過臨床、疾控、食品安全、水產畜牧等多行業(yè)近萬個樣本的實際驗證,(種、亞種級)準確率高達95%以上。融智生物認為,基于生物組學的QuanID微生物數(shù)據(jù)庫代表了新一代質譜微生物數(shù)據(jù)庫的發(fā)展方向,將取代傳統(tǒng)的建庫方式。
在全新建庫方式之外,融智生物還與多家國內知名菌種保藏單位合作,不斷完善本地特有微生物數(shù)據(jù)庫的建設,使得該微生物數(shù)據(jù)庫不僅可勝任國際通用微生物鑒定,同時,更適合國內用戶需求。未來,融智生物還將進一步快速擴展微生物數(shù)據(jù)庫容量,使微生物質譜可適用于更廣泛的行業(yè)。
QuanID微生物鑒定質譜系統(tǒng)
2017年,融智生物宣布推出新一代寬譜定量飛行時間質譜QuanTOF,基于該質譜平臺,融智生物開發(fā)了包括糖化血紅蛋白定量檢測系統(tǒng)、QuanID微生物鑒定質譜系統(tǒng)、SNP基因分型質譜系統(tǒng)、豬肉品質鑒定系統(tǒng)等多個應用產品。該平臺于2018年4月被由兩院院士等專家組成的專家委員會評定為“整體性能達到世界先進水平”。