上接:The Scientist:2014年度十大創新產品(top1-5)
Top 6:TCS SP8 STED 3X(Leica顯微系統)
繼SR GSD 3D評上去年的十大創新之后,Leica公司攜另一款超高分辨率平臺TCS SP8 STED再度上榜。去年十二月發布的TCS SP8 STED 3X可以進一步深入細胞進行三維成像,超高分辨率的成像速度達到了好幾楨每秒。牛津大學的分子免疫學家Christian Eggeling正在通過STED 3X研究哺乳動物細胞表面的免疫受體,他的團隊還在用這一技術獲取細胞內部結構和分子的3D圖像。“3X升級之后能為我們揭示細胞核和細胞骨架的更多線索,”他說。
STED(受激發射損耗)是2014諾貝爾獎得主Stefan Hell開發的,該技術能對亞細胞結構和納米級動態進行超高分辨率的光學成像。據Leica公司的產品經理Jochen Sieber介紹,TCS SP8 STED 3X在XY平面上的分辨率大約為30 nm,z軸分辨率也達到了100 nm以內。正因如此,STED 3X能夠生成高度精確的3D圖像?!吧飳W活動發生在三維空間里,我們希望以同樣的方式進行觀察,”Jochen說。
點評:STED 3X可以觀察到前所未有的細胞細節。這個超高分辨率技術可以在納米水平上成像亞細胞結構、細胞隔室、蛋白互作和不同結構的相互關系,支持活細胞觀察。
Top 7:exVive3D肝臟(Organovo公司)
在許多研究領域,體外人類器官模型可能會最終替代動物模型。Organovo公司的exVive3D肝臟模型就是一種這樣的產品。與永生細胞系等傳統體外模型不同,該產品模擬了人類肝臟的宏觀和微觀3D結構,包含有肝臟中的不同細胞類型,比如肝臟實質細胞、成纖維細胞、內皮細胞和肝星狀細胞?!案闻K組織的結構和組成是很重要的,”Organovo公司的執行副總裁Michael Renard說?!皩⒄_類型的細胞以正確比例正確定向,就能實現與肝臟組織非常類似的結構、性能和行為?!?/P>
今年四月發布的這個3-D肝臟組織,由Organovo公司專利的生物打印技術生產。該技術可以在各種培養容器中打印,比如24孔板。exVive3D肝臟能合成天然的肝臟蛋白(白蛋白、轉鐵蛋白等)和膽固醇,還能保持細胞色素P450的活性。這個實驗平臺很好地模擬了人類肝臟的真實功能。
“這一點對于毒理學來說非常關鍵,”Hamner健康科學研究所的毒理學家Ed LeCluyse說,他也是exVive3D肝臟模型開發時的顧問?!疤拱渍f,許多傳統的高通量系統并不符合我們的要求?!彼J為這個產品能改變藥物開發和環境毒素的檢測方式。
點評:這一產品離活體模型更近了一步,能讓研究者對自己的發現更有信心。如果exVive3D肝臟模型比傳統動物模型更加好用,那將是藥物研發領域的一大突破。
Top 8:HAP1 Knock-Out Cell Lines(Haplogen Genomics公司)
HAP1是類似成纖維細胞的永生細胞系,主要用于生物醫學研究。這種細胞系的獨特之處在于,它很接近單倍體,絕大部分染色體只有一個拷貝。
為了拓展自己的產品線,奧地利公司Haplogen Genomics今年三月發布了新人類HAP1細胞系服務,可以根據用戶需要用CRISPR-Cas9技術敲除任何基因。“人們總是向我們咨詢一系列基因,但我們產品常常不全,”Haplogen公司的CSO Tilmann Bürckstümmer解釋道?!斑@是一個重要問題,因為越來越多的人希望研究基因家族或整個通路?!?/P>
Haplogen公司現在擁有八百多種以CRISPR為基礎的基因敲除HAP1細胞系,而且這個產品庫還在不斷增大,差不多每個月增加一百個基因。用戶也能以同樣的價格定制細胞系,敲除任何自己感興趣的基因。這種自定義服務通常需要八到十周。
劍橋大學的分子生物學家Steve Jackson正在使用這種CRISPR修飾的細胞系進行研究。這些細胞系被敲除了不同的去泛素化酶(DUB)編碼基因,而DUB被認為在DNA修復中起到了一定的作用。“目前這項研究還處于初級階段,希望能夠處理好這些HAP1基因敲除細胞系,”Jackson說。
點評:這是一個系統性的方案,可以通過基因敲除最終注釋所有人類基因的功能。用CRISPR生成基因敲除細胞系,速度更快成本也更低。
Top 9:PreciseType人類紅細胞抗原測試(Immucor公司)
血型相配對于輸血來說是至關重要的。除了血型以外,血庫和醫院還要篩查紅細胞表面的罕見抗原以便全面評估兼容性。Immucor公司的PreciseType HEA test比傳統血清學篩選更加精確,所用的時間更短。這種分子診斷產品能夠篩查控制35種抗原表達的基因,鑒定罕見的生物學指標,幫助醫生降低同種免疫的風險,減少與輸血有關的其它有害反應。
“對于接受多次輸血的患者而言,篩查更多血型抗原是很有幫助的,”Immucor公司的首席科學家Joanne Spadoro說。PreciseType“可以一次性檢測多個不同抗原,”這一技術的開發者Sukanta Banerjee介紹道。
今年五月,PreciseType成為首個獲得FDA批準的輸血配型體外診斷產品。
美國西北紀念醫院的Ricardo Sumugod等人一直在用PreciseType進行研究。這個團隊最近在一次會議中,展示了他們通過PreciseType和定向測序發現的新血型。這種分子分型產品“比目前的血清分型更加準確,”Sumugod說。
點評:該產品能夠更準確的進行血型匹配,這無疑是醫療保健的一大進步。
Top 10:Sciencescape
Sam Molyneux在多倫多大學讀博士的時候,遇到了一個我們大家都不陌生的問題:浩如煙海的文獻?!拔恼绿嗔?,基本上沒人搞得清楚每天、每周或者每月有什么新成果發表,” Molyneux說。
于是他與從事Web開發的姐姐Amy合作,建立了學術研究平臺Sciencescape。Sciencescape提供了“類似Twitter的體驗,”Molyneux說。用戶選擇好類別之后,可以瀏覽個性化的新聞,了解相應類別中新發表的文章。目前Sciencescape已經設立了超過五千萬個類別,包括特定主題、研究者、基因、疾病、蛋白、雜志等等。Molyneux還希望添加地理位置、建筑物、研究所、特定材料和方法等新類別。
Sciencescape平臺對學術圈是免費的,目前已經擁有了十七萬用戶。去年十一月開發者們發布了測試版,今年十月他們又推出了最新版本。