陳國南表示，除了眾所周知的微生物污染、食物源頭污染、化學品污染等問題外，目前我國食品安全領域還存在貿易與技術壁壘。
陳國南介紹，中國農產品出口額由1996年的143.40億美元增加到2012年的632.9億美元，年均增長速度為9.7%。然而，中國仍然約有90%的農業出口企業受國外技術性貿易壁壘影響，每年損失百億美元左右。
例如，對我國輸出日本的大米和輸出歐洲的茶葉，國外要求檢測100多種農藥殘留而且要求的最高殘留限量為目前先進檢測方法的檢測低限。在農藥殘留的檢測中要求一次能進行上百種農藥的多殘留分析。這就要求我們提高自身的檢測技術水平。陳國南表示，目前，現代分子生物學技術與信息科學的結合產生的新技術可顯著提高食源性疾病的病原體監測和溯源能力，這一技術目前我們國家已經在發展，但與國際先進水平仍存在差距。
陳國南還認為，我國現有的食品安全技術措施與國際水平不一致的原因之一，就是沒有廣泛地應用危險性評估技術，特別是對化學性和生物性危害的暴露評估和定量危險性評估。如沙門氏菌、大腸桿菌O157:H7等致病菌對不同人群和個體的致病劑量尚不清楚;瘋牛病與人的克-雅氏病之間的確切關系尚待闡明;國際上所報導的男性精子減少是否確與二噁英和氯丙醇等環境內分泌干擾物的暴露增加有關。
國際經驗表明，實現從“農田到餐桌”的全過程管理，建立從源頭治理到最終消費的監控體系對于保障食品安全十分重要。在這些方面，我國科學數據尚不充分，需要開展基礎研究。
陳國南說，我國部分出口食品企業已應用了HACCP技術，但缺少覆蓋各行業的HACCP指導原則和評價準則，從而需要制定這一先進技術的指導原則和評價準則，以便在我國廣泛應用。
陳國南介紹，我國現行標準與國際不接軌，內容不完善，技術落后，實用性不強、特別是在有毒有害物質限量標準方面缺乏基礎性研究，在創新性方面差距更加明顯。許多產品標準沒有充分利用“危險性評估”原則,考慮總暴露量在各食品中的分配狀況，現行食品衛生標準的覆蓋面不廣。經常是國外設定一個技術壁壘后，我國有關部門才開始著手建立相關標準。這種被動的局面已經給我國農產品在國際市場上的形象和競爭力帶來了很大的負面影響。因此，需要將危險性評估技術引進我國食品安全標準領域開展基礎研究，以有利于我國農業產業和食品工業結構調整并促進市場競爭力。
