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安捷倫科技將生物信息學系統擴展為綜合生物學套裝

   2011-12-02 中國化工儀器網1026

      2010年 11 月 15 日,北京 — 安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日發布了GeneSpring GX 11.5,這是廣泛使用的生物信息學軟件的擴展版,能夠對多種類型的生物學數據進行可視化和分析。目前 GeneSpring GX 11.5 是首款可同時對外顯子芯片、蛋白組學和代謝組學實驗進行解讀的軟件,該工具的界面與以前的版本類似。

  這些新功能與現有的 GeneSpring GX 應用相結合,用于基因表達分析、基因組拷貝數分析、全基因組關聯分析以及轉錄組學數據分析。

  安捷倫副總裁兼生物系統部總經理 Gustavo Salem 說:“安捷倫致力于提供精密的新型儀器和軟件工具,以幫助研究人員實現系統生物學的美好前景。這個多組學生物信息學軟件只是我們致力于推動未來生物醫學研究突破的一部分。”

  Agilent GeneSpring GX 11.5 是與 Strand Scientific Intelligence 公司聯合研發的,基于 Strand的 Avadis技術平臺之上,該平臺專門為科學家簡化和應對復雜的生命科學挑戰而設計。

  GeneSpring GX 11.5 增加了用于選擇性剪接、代謝組學和蛋白組學分析的新功能,還改進了現有的分析和可視化工具。

  在基因組學方面,GeneSpring GX 11.5 的剪接分析得到了極大的擴展與改進,可支持新推出的安捷倫外顯子芯片平臺。借助 Agilent SurePrint G3 外顯子芯片,研究人員可在一次實驗同時鑒別出基因水平和外顯子水平的表達差異,從而捕獲到微小但至關重要的生物變化。使用安捷倫 GeneSpring GX 11.5 生物信息學系統,研究人員可同時分析基因水平和外顯子剪接水平的數據,在生物學環境中理解復雜的基因表達行為,從而提高效率,加速研究進程。

  GeneSpring GX 11.5 集成了 Agilent Mass Profiler Professional,從而增加了全新的代謝組學和蛋白組學分析功能,并能在 GeneSpring 平臺上實現安捷倫質譜分析的所有功能。現在研究者可以在同一窗口中加載多種分別代表了轉錄組學、基因組學、代謝組學和蛋白組學的實驗類型。這樣用戶就可以在多個實驗間切換自如,不再需要單獨加載各個實驗。

  這種組織方式還使得研究者進行生物學研究時,可以便捷地將多類數據結合到一個邏輯單元中,并同時比較不同實驗類型的結果。

  GeneSpring 的一個重要特點是用戶可方便地比較異構數據,并且能深入地進行生物學處境化。不同芯片平臺和有機體間的探針自動翻譯使得研究者可以通過簡單的拖放功能,進行結果比較。這項無縫翻譯技術使研究者可以快速鑒別具有統計學顯著重復內容的實體列表。

  GeneSpring 11.5 版本為客戶增加了先進的數據管理功能,如綜合備份工具和改進的數據遷移工具。它還整合了 GeneGo 的MetaCore 路徑分析工具,使 GeneSpring 的統計分析與 MetaCore 的路徑分析優勢得以強強聯合。

 
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