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10x Chromium X系列百萬單細胞系統重磅上線!

   2021-08-11 1139
核心提示:近年來,單細胞測序技術的迅速發展和應用推廣,為科研人員從多維度揭示生物發育、腫瘤發生發展、感染與免疫,以及藥物研究等領
       近年來,單細胞測序技術的迅速發展和應用推廣,為科研人員從多維度揭示生物發育、腫瘤發生發展、感染與免疫,以及藥物研究等領域的科學問題提供了有力的工具。而在目前商業化的高通量單細胞測序技術之中,10x Genomics的Chromium平臺是應用最為廣泛的解決方案,助力國內外的科研、轉化和應用機構來解決復雜的生物學問題,從而改善人類健康。Chromium單細胞解決方案可從基因表達、染色質可及性、細胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特異性以及CRISPR編輯等多個角度解析生物復雜性,實現真正的單細胞多組學分析。

 

10x Genomics的經典款儀器Chromium Controller,輕巧便攜,是您實驗室自用、外出服務的必備神器,而于2020年推出的自動化建庫工作站Chromium Connect,從細胞懸液到可用于測序的文庫,可最大限度地減少不同用戶、不同樣品甚至不同地點的單細胞數據差異,大大提高實驗室效率。

 

 

然而,隨著單細胞測序的不斷發展,研究人員對能夠分析數十萬甚至數百萬細胞大規模研究的需求不斷增加,如研究免疫學和傳染病反應,對大腦和神經系統等極其復雜的系統進行深入分析,對整個發育階段的細胞類型進行完整的圖譜分析,以及大規模單細胞 CRISPR 和藥物篩選等。而更高通量的研究往往耗時耗力、費用高昂,因此,如今10x Genomics Chromium X系列解決方案應運而生。

 

 

10x Genomics Chromium X是一種新型高通量單細胞測序文庫構建解碼系統,單次最多運行上百萬細胞,可大大降低檢測成本。那么它是怎么做到的呢,數據表現又如何?別著急,我們將通過Q&A形式為您一一揭曉~

 

10x Chromium X如何實現單次運行百萬單細胞?

與10x 之前推出的兩款儀器Chromium Controller和Chromium Connect相同,最新推出的Chromium X系列產品也是基于Next GEM技術研發,其核心之處在于采用先進的微流控技術,可在幾分鐘內完成成千上萬個單細胞微滴生成和條形碼標記,而每個微滴都含有一個可識別的條形碼,便于下游分析。

而與之前的Controller和Connect兩款儀器的8通道,每個通道最多捕獲10,000個細胞不同的是,X儀器有16個通道,每個通道最多捕獲20,000個細胞,再結合10x的CellPlex多樣本混樣技術,每個通道最多可捕獲60,000個細胞,去除雙細胞率后,每張芯片最多可捕獲750,000個單細胞。

 

10x Chromium X系列儀器有幾款,有什么區別?

10x Chromium X系列儀器有兩款,iX和X,兩款儀器外觀相同,但性能不同。X是最全能的一款儀器,從低通量LT到標準通量Standard到高通量HT全部兼容,具有超高的靈活性,無論是入門級的試點研究,還是進行大規模的超高通量實驗,都能完美兼容,并可運行多種應用如單細胞基因表達、免疫分析、ATAC及Multiome;iX可謂是X的入門款,兼容LT和Standard,可通過購買升級包直接升級到X,進而運行高通量試劑盒HT,實現單次運行百萬細胞。當然,iX比X價格更低,是一種經濟實惠的選擇。

 

單次實驗這么高的通量,成本究竟能降低多少?

10x Chromium X搭配高通量的試劑盒HT,可使總體實驗成本降低70-80%,單個細胞的成本降低多達7倍!

 

使用10x Chromium X儀器的數據表現怎么樣?


1. 
在Chromium Controller和X兩款儀器上運行標準通量產出數據對比

10x使用Standard標準通量的試劑盒分別在Chromium X和Chromium Controller上進行了不同應用(單細胞基因表達、免疫分析、ATAC及Multiome)的內部測試實驗,兩者產生的數據非常相似,說明標準通量的試劑在兩款儀器上運行可產生基本一致的實驗結果。

2. 在10x Chromium X儀器上運行標準通量和高通量試劑產出數據對比

10x使用 Chromium X 和新 HT 試劑盒進行了一項內部研究,以評估 7 種不同的藥物化合物對 2 種非小細胞肺癌細胞系隨時間的影響。結合CellPlex 技術,將來自相同處理的樣品進行混樣處理,并在Chromium X 上運行單細胞基因表達Standard和 HT 兩種解決方案。基因中位數和UMI檢出率以及UMAP圖中的聚類分析均表現出高度相似,二者的t-SNE投影圖也高度重疊。

然后用基因表達數據來注釋細胞群,主要的細胞亞型如 B 細胞、T 細胞、自然殺傷細胞和單核細胞,以及健康的肺細胞和腫瘤細胞,都可以很好地鑒定區分。疊加抗體數據后,健康的肺細胞如肺泡上皮細胞和纖毛細胞,在 HT 和標準方案中都能檢測到。但綠色的 ELF3+/EPCAM+ 細胞群僅存在于 HT得到的數據中,而單獨使用Standard方案無法檢測得到。說明高通量和標準通量可產生可比擬的數據結果,但高通量解決方案比標準通量更能檢測出稀有細胞類群。

 

10x Chromium X可以用于哪些應用方向?

10x新的Chromium X 和單細胞高通量 HT 解決方案能夠在廣泛的研究領域實現新的應用。從對不同患者群體的深度免疫組庫分析,到在癌癥樣本中尋找超稀有的腫瘤細胞,到構建復雜的大腦和神經系統的綜合圖譜,再到大規模的單細胞 CRISPR 篩選和藥物鑒定等。

10x Chromium X系列單細胞系統可以根據您需要的實驗規模開展任何10x Genomics單細胞實驗,并具有業界最高的通量靈活性,可分析數百至百萬級的細胞。俗話說早就是優勢,早點邁入單細胞研究的新臺階,解鎖10x Chromium X為您帶來的無限可能,也就把握了高通量單細胞研究的先動優勢。X系列現已接受預定,早預定早發貨,欲購從速!

 
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