截止到2013年7月，根據國家質量監督檢驗檢疫總局發布的統計數據，國內獲取食品檢驗機構資質認定(CMAF)的檢測機構總計3500-3900家(質檢總局公布的數據是3503家，認監委肖亮在第五屆中國第三方檢測實驗室發展論壇暨實驗室展覽會公布的數據是3827家)，其中國家級獲證機構410家。

　　圖1 各省獲證食品檢測機構分布圖

　　圖2 食品檢測機構系統系統分布百分比

　　2013年，全國疾控中心總計3522家，其中具有CMAF資質認證的中心數量為1625家，約占整體數量的46.14%。雖然從數據上看，具有CMAF認證的疾控中心在整個疾控體系中比例較高，但是目前的疾控中心基本是有原來的防疫站更名成立的，尤其是地市級和縣級的疾控中心更是如此，并且這類擁有CMAF資質疾控中心大部分從事食源性疾病的檢測，食品和農產品的質量安全檢測能力薄弱。

　　由于大部制改革還在逐步整合，目前食品藥品及技監系統均有從事食品檢測的檢測機構。根據國家產品質量技術監督管理總局公布的數據，技監系統和食品藥品系統的獲證食品檢測機構總計1299家，具體省份分布請見下表：

　　表1 1299家技監、食品藥品系統食品檢測機構分布情況

　　民營的食品檢測機構數量為116家，主要集中在上海、浙江、廣東、山東等沿海城市。

表2 116家民營食品檢測機構分布情況