無菌均質器的 設計可以確保濺出樣品處理液保留在處理器的處理室內，在清潔過程中要確保斷開電源。在清潔處理器外部表面以及振蕩器時，先用溫和的肥皂水清潔，然后再用柔軟的布輕輕擦干（若處理器內部被細菌污染，則用70％異丙基乙醇液進行處理）。
不要使用酸、堿以及氯溶液和鹽溶液清潔處理器的外部，另外避免有機溶劑損壞處理器。
在清潔過程中不要采用沖刷和刮的方式，否則易對處理器造成不可逆轉的損壞。
如果采用的清潔方法不同于前面提到的，則要向生產廠或代理商咨詢，明確所采用的方法是否會損壞儀器。
常規注意：
樣品處理器處理腔門上的微型開關可以確保處理器在進樣門沒有正確關好時，儀器不能運行，請勿做出妨礙微型開關正常運作的任何行為。當運行噪音加大或有變化時，要及時向生產廠或供應商報告，以便能及時妥善處理。
