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DropSense96超微量光譜儀的特點和優勢

   2025-06-13 上海典奧生物科技有限公司1338
    比利時Trinean公司的 DropSense96是一臺多通道分光光度計(spectrophotometer),可快速、精確地對微升級液滴進行全波段UV/VIS(紫外光/可見光)光譜分析,樣品范圍包括DNA/RNA,蛋白質和小分子化合物。DropSense96包含plate reader的所有特性,但使用的是特殊的可檢測1-3µL樣本的DropPlates。
 
圖1. DropSense96微量小分子檢測儀
 
關鍵特性:
(1)液滴樣本體積:<3µL;
(2)4+1光學通路,可同時檢測4個樣本;
(3)可進行全波段的UV/VIS(紫外光/可見光:220-750nm)光譜分析;
(4)可在有污染物存在的條件下對生物分子(如DNA/RNA)進行定量檢測;
(5)檢測迅速:測量一個樣品耗時3s,一個96孔板耗時<5min;
(6)寬廣的動態范圍:無需額外的稀釋步驟(從5到5000ng/µL雙鏈DNA,無需稀釋);
(7)寬廣的線性范圍:0.1-100OD(10mm path equivalent);
(8)測量時每50ms進行一次光譜分析,得到高準確度和高質量數據;
(9)使用靈活:可手動操作,也可與移液器機械臂整合,進行高通量實驗;
(10)易于進行樣本數據輸入和結果輸出(可與LIMS實驗室信息管理系統相兼容)。
 
DropSense96超微量光譜儀的技術背景
    樣本的質量控制(sample QC)是很多基因組學應用的瓶頸。目前的定量方法有其局限性,如其吸收是非特異的,但也有優勢,如益于操作,在一定程度上也能提供關于樣本質量的信息(如吸收比率)。熒光檢測雖然特異性強,但價格昂貴、耗時,并且也無法提供更多的關于內容物的信息。
    DropSense96的UV/VIS光譜測量法是一種光學技術,用來測量樣品的吸收特性和熒光特性,能提供樣品中的物質濃度等信息。當測量全光譜時,能運用更多的先進的分析技術,如對一個樣本中的不同標記物質進行多元感應。
    Trinean開發了專利的緊湊的多通道分光光度計DropSense96,能將簡化的光學元件設計和重要的在通量、靈敏度和穩定性方面的優勢結合起來。
    DropSense96能同時檢測多個樣本的UV/VIS(紫外/可見光)全光譜。它能測量樣本的吸收特性,并提供樣本中物質的濃度水平的信息,如核酸、蛋白質或化學物的吸收值和濃度(µg/µl和pmol/µl)。
    DropSense96可以用一個直接的方法實行差異化測量,可彌補漂移、溫度等二次效應(secondary effects),得到更高的準確度。
 
圖2. 獨特的光學分光光度計設計(已獲專利)將圓筒形透鏡和整合的光學元素、高分辨率光柵和超靈敏光電二級管陣列結合起來。
 
DropSense 96超微量光譜儀的軟件設計
可用3種軟件方法計算生物分子濃度、操作儀器:
(一)DropQuant TM 軟件:
    可對基于A260nm吸收的DNA、RNA和基于A280nm吸收的蛋白質進行定量檢測,得到傳統的樣本濃度和經典的A260/A280、A260/A230比值。
此軟件易于操作,對實驗方法的建立、微孔板的布局和輸入/輸出數據有廣泛的選擇性。
 
特點:
(1)多用戶水平;
(2)快速定義實驗;
(3)點擊即可輸入樣本信息(.xls, .txt, .csv);
(4)實時跟蹤檢測;
(5)可全覽吸收曲線;
(6)快速輸出或定制報告選項(.xls, .pdf, .txt, .csv);
(7)與LIMS實驗室信息管理系統相兼容;
(8)與cDropTM軟件直接相連。
 
具體軟件使用方法:
(1)定義芯片和微孔板的布局,包括空白孔、樣本孔、重復孔和/或稀釋孔。手動輸入保存后的微孔板布局。點擊“Start Test”即可開始測量。
(2)測量后能立刻顯示實驗結果。結果以96孔的形式顯示,或以列或單個孔的形式顯示。用顏色跟蹤測量時遇到的問題(如孔中沒有樣本,則用紅色空格顯示)。
(3)單孔顯示時,允許在一個窗口中將曲線和濃度進行重疊,全覽時可觀察到更多的細節信息。
(4)多輸出選項可快速輸出到Excel中,可得到全部自定義的報告(xls,txt,pdf,print等)。可與LIMS實驗室信息管理系統相兼容。
 
(二)cDrop TM 軟件:
cDrop TM 分析軟件是一種新型的分析工具,是作為DropQuant軟件的補充而設計的。它使用基于專利的內容物分析方法,可對復雜樣本中的生物分子(DNA、RNA、蛋白質、寡糖(Oligo)、PCR產物)進行特異性定量檢測。對比那些用于HPLC,IR-或NIR分析的傳統的化學計量學方法,它利用先進的數學算法(專利正在申請中)排列復雜性。它通過定義樣本中核酸和污染物(如蛋白質、鹽類和苯酚)對光譜吸收值的貢獻,來提取準確的定量信息。結果,測量光譜被分解成不同樣本成份的光譜,從而對目標生物分子進行特異性定量,并評估樣本的質量。這一突破性方法可得到高度特異和準確的定量結果。
   cDrop TM軟件是對提取樣本進行質量控制,或在進行更先進、更昂貴的分子測試前對提取過程本身進行評估的理想工具。
 
cDrop TM 軟件可放大UV/VIS光譜曲線:
(1)UV/VIS測量窗口:
cDrop TM 軟件可顯示所有的UV/VIS光譜數據,并從吸收結果中計算出A260的DNA/RNA濃度或A280的蛋白質濃度。
(2)內容物分析窗口:
cDrop TM 軟件基于樣本來源、樣本類型(DNA、RNA、PCR產物…)、提取物或采用的實驗方法來選擇檢測的實驗方案。在此方案中,包含UV/VIS參比光譜表(reference spectra)。
(3)內容物分析窗口:
將參比光譜加入測量光譜,可對目標成份進行特異性定量,并估算樣本中的污染物的濃度。
(4)內容物統計窗口:
可顯示所有樣本的內容物分析概況。所有可能增加吸收光譜值的檢測成份都在圖表中列出,包括混濁度檢測(turbidity check),使用戶能對微孔板上樣本的質量有一個清楚的整體認識。
 
圖3. cDrop軟件在DNA定量檢測中使用的示意圖。 下方的圖表表示在對從大量血樣中提取的DNA進行定量時,將cDrop方法和2個傳統方法(A260和Picogreen)進行對比分析。
 
圖4. cDrop軟件在RNA定量檢測中使用的示意圖。下方的圖表表示對從Hek293細胞中分離的2個RNA進行cDrop內容物分析,顯示胍鹽污染物的濃度有很大的不同。RIN值顯示為插入值。
 
cDrop TM 分析軟件的關鍵應用:
(1)特異性的DNA、RNA定量;
(2)DNA、RNA的提取優化;
(3)PCR、qPCR之前的標準化;
(4)生物樣本存儲的質量控制;
(5)測序前樣本的質量控制;  
(6)RNAse或Dnase的效率;
(7)PCR擴增子的特異性定量。
 
cDrop TM 分析軟件的特征:
(1)污染物分析;
(2)混濁度分析;
(3)統計學分析。
 
(三)DropControlTM(API)軟件
DropSense96可作為獨立的多色分光光度計使用,或可被整合入全自動的環境中。Trinean DropSense96被設計成可與移液器機械臂相整合:
 
物理整合:
(1)DropPlate被設計成可用移液器機械臂進行自動分配樣本(尺寸與SBS標準相兼容,并且微流體曲折部件(the microfluidic meander)的樣本自我填充技術使充滿后的DropPlate有更長的存儲時間);
(2)儀器的一次性耗材(the disposable)和進/出板架(in/out tray)的機械設計與移液器機械臂的抓手相兼容。
(3)儀器具有能標示儀器在工作臺面上的位置的機械特征。
 
軟件整合(API):
(1)Trinean提供一個“應用程序界面(application programming interface,API)”進行第三方程序與DropQuant軟件或腳本(script)的交流和溝通。
(2)在遠程模式中(典型的,當DropSense96儀器在一個全自動的實驗環境中,與移液器機械臂進行整合時),腳本與DropQuant軟件相溝通,并控制測量過程。一旦此腳本運行,就無需進行進一步的用戶互動(舉例而言:無需點擊“start button”來裝載新的一次性耗材:作為替代,腳本會傳送指令到DropQuant軟件上進行板架的打開和關閉)。
 
DropSense 96超微量光譜儀的技術參數
(一)產品技術參數:
(1)類型:4通道多色分析儀+1個參比通道;
(2)光學原理:紫外/可見光范圍的超靈敏度二極管陣列光譜儀;
(3)光學元件組合:Catadioptric Czerny-Turner (專利號:US 7,864,317 B2);
(4)光源:6W氙氣閃光燈,壽命109 flashes;
(5)波長范圍:220-750nm;
(6)波長分辨率:<3nm;
(7)波長準確度:0.5nm;
(8)波長重復性:0.1nm;
(9)光譜范圍:0.0005 – 2.0 OD;
(10)吸收精密度:0.003 OD;
(11)全波長獲取:20/s;
(12)AD轉換:16bit。
(二)兼容微孔板類型:
(1)DropPlates 16S,16D:多達6個,使用鋁框;
(2)DropPlates 96S,96D:SBS形式,無需支架;
(3)商用的96-孔UV/VIS(紫外光/可見光)兼容微孔板。
(三)其他技術參數:
(1)系統啟動時間:包括系統自檢,耗時<2min;
(2)操作系統:計算機控制(Windows系統);
(3)軟件兼容性:DropQuantTM和cDropTM(所有版本);
(4)連接:USB;
(5)電源:110-240V,50/60Hz(操作電壓:24VDC);
(6)尺寸:34×45×35cm(W×D×H);
(7)重量:30kg;
(8)遵守協議:CE(未來為CSA)。
 
    目前,此新型生物分子定量檢測平臺包括以下4個組成:
(1)DropSense96,專利的多色分光光度計;
(2)DropPlatesTM,微流體16孔芯片(microfluidic 16-well chips)和96孔微孔板(96-well plates);
(3)DropQuantTM軟件,用戶友好型的軟件可以建立并運行吸收光譜測量;
(4)cDropTM分析軟件,具有突破性的算法,可對樣本在UV/VIS光譜范圍內進行特異性的定量(專利正在申請中)。
 
標簽: 光譜儀
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