安捷倫科技針對(duì)新一代測(cè)序的定制靶向序列捕獲試劑盒序列范圍擴(kuò)展5 倍，堿基覆蓋可高達(dá)34 Mb
2011 年4 月12 日，北京
安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日宣布推出用于新一代測(cè)序（NGS） SureSelect XT靶向序列捕獲系統(tǒng)的最新定制試劑盒，該試劑盒可捕獲高達(dá)34 Mb 的目標(biāo)基因組區(qū)域。
新版定制試劑盒的序列覆蓋范圍比舊版擴(kuò)展了5 倍，這使得研究人員能夠?qū)⒀芯糠秶鷱娜祟愅怙@子擴(kuò)展到對(duì)動(dòng)物、微生物、植物及其它生物體中較大的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行測(cè)序，目前尚沒(méi)有針對(duì)此類研究的商業(yè)化預(yù)定義或目錄版的靶向序列捕獲試劑盒。
現(xiàn)在研究人員可以利用目錄試劑盒或定制試劑盒對(duì)高達(dá)34 Mb 的序列進(jìn)行研究，這種撒大網(wǎng)的方式有利于發(fā)現(xiàn)SNP、插入/缺失以及拷貝數(shù)變異。然后他們可以設(shè)計(jì)有針對(duì)性的自定義序列捕獲文庫(kù)，用于后續(xù)的大量樣品研究。安捷倫提供eArray在線靶向序列捕獲和芯片設(shè)計(jì)工具，可幫助用戶設(shè)計(jì)并訂購(gòu) SureSelect XT 定制版靶向序列捕獲試劑盒（可選 10 到5000 次反應(yīng)，及適用于各種主流 NGS 平臺(tái)的格式）。
安捷倫SureSelect 平臺(tái)市場(chǎng)總監(jiān)Fred P. Ernani 博士說(shuō)：“安捷倫在定制長(zhǎng)鏈寡核苷酸制造方面的出眾能力再加上eArray 設(shè)計(jì)工具的強(qiáng)大功能，能夠?yàn)檠芯咳藛T帶來(lái)卓越的具有高度靈活性且可定制的NGS 靶向序列捕獲系統(tǒng)。現(xiàn)在，安捷倫能夠?yàn)檠芯咳藛T提供 200 Kb 到34 Mb 的大范圍定制捕獲試劑盒，幾乎適用于任何規(guī)模的研究。”
隨著測(cè)序結(jié)果的不斷產(chǎn)生，研究人員可以不斷采用 SureSelect 和eArray 工具反復(fù)進(jìn)行快速設(shè)計(jì)和完善。現(xiàn)在，SureSelect XT 用戶擁有全面的文庫(kù)設(shè)計(jì)選擇，從可直接使用的目錄版試劑盒到結(jié)合了目錄版和定制版內(nèi)容的復(fù)合設(shè)計(jì)試劑盒，再到完全定制設(shè)計(jì)的試劑盒。
擁有DNA 靶向序列捕獲和RNA 靶向序列捕獲的SureSelect XT 產(chǎn)品線成為應(yīng)用范圍最廣的新一代靶向測(cè)序技術(shù)平臺(tái)。定制試劑盒的不斷發(fā)展使得早期使用的客戶能夠捕獲超過(guò)60 Mb 的序列。
靶向序列捕獲工作流程
靶向序列捕獲使研究人員可以僅對(duì)目標(biāo)基因組區(qū)域（而非整個(gè)基因組）進(jìn)行測(cè)序，從而簡(jiǎn)化NGS工作流程。結(jié)合領(lǐng)先的新一代測(cè)序系統(tǒng)的更高速度，SureSelect XT的多重檢測(cè)支持功能使得研究人員在每次實(shí)驗(yàn)中都能更全面地認(rèn)識(shí)更多樣品的基因組，這在過(guò)去是難以實(shí)現(xiàn)的。文庫(kù)制備和靶向序列捕獲流程的瓶頸已經(jīng)得到有效解決。
為進(jìn)一步提高處理通量，安捷倫還提供了集成式工作站，用于自動(dòng)化完成SureSelect XT文庫(kù)制備和靶向序列捕獲工作流程。可針對(duì)多重測(cè)序?qū)悠愤M(jìn)行索引，且所有試劑都適合自動(dòng)化操作。不久之后，安捷倫的Bravo 自動(dòng)化液體處理系統(tǒng)所支持的自動(dòng)化方案將增加RNA 捕獲自動(dòng)化統(tǒng)包方案。
SureSelect 靶向序列捕獲平臺(tái)作為基因發(fā)現(xiàn)的核心工具，現(xiàn)已被50 多篇同行評(píng)審的論文所引用。《科學(xué)》雜志12 月17 日刊登的2010 年十大科學(xué)突破中，其中兩項(xiàng)突破“Reading the Neandertal Genome”（解讀尼安德特人基因組）和“Homing In on Errant Genes”（外顯子組測(cè)序/罕見(jiàn)疾病基因）均采用了本系統(tǒng)。
