《意見》要求改革完善公共衛生監測預警體系。以傳染病為重點，優化哨點監測布局，擴展疾病監測種類。運用大數據、人工智能、云計算等數字技術，加強對相關數據的實時監測和動態分析，提升公共衛生風險評估和預警能力。今年9月底前，建成公共衛生大數據運用平臺，初步實現疫情風險研判和預警功能。
改革完善公共衛生預防控制體系。優化省疾控中心設置與職能，提高專業技術人員編制占比，推動疾控與臨床密切結合，提升對全省重大疾病和傳染病防控的業務管理能力。省、市兩級疾控機構要加強預防醫學科學研究，提高對區域重大疾病防控的應用性技術研究水平。縣級加強疾病預防控制和健康管理的組織實施、指導評估。力爭利用3年時間，全面建成專業化、現代化的三級疾病預防控制網絡。
2020年6月底前，縣級以上疾控機構全部建成生物安全二級實驗室，具備開展新冠病毒、流感病毒、腸道病毒和艾滋病病毒等常見病原體的核酸檢測和抗體檢測等能力。強化學校衛生、職業衛生、食品衛生、環境衛生、放射衛生等公共衛生職能，提高公共衛生健康危害因素監測與干預能力。
到2022年，空氣對人群健康影響監測和公共場所健康危害因素監測以市為單位全覆蓋；食品安全風險監測評估、學生常見病及健康影響因素監測、放射性與職業病危害因素監測以縣為單位全覆蓋；飲用水監測以鄉鎮為單位全覆蓋。
為改革完善公共衛生醫療救治體系，增強救治能力，《意見》要求2022年年底前，省及各市依托一家三級綜合醫院設立不少于50張符合傳染病防控要求的床位，加強ICU能力建設，承擔重癥救治任務。
2020年年底前啟動建設山東省公共衛生臨床中心，在青島、菏澤設立分中心，總床位規模不低于3000張。各市要依托現有資源設立一所達到三級標準的市級傳染病醫院。力爭到2022年，全省傳染病臨床診療規模達到1萬張床位以上。
2021年年底前，在濟南、青島、煙臺、濟寧、聊城、臨沂、濱州等市完成公共衛生事件應急救援區域中心設置，逐步構建“陸海空”立體化緊急救援網絡。
