省部共建眼視光學和視覺科學國家重點實驗室運行期間，浙江省人民政府是實驗室建設和管理的責任主體，按照省部共建、以省為主的建設和管理原則，不斷創新機制、突出地方特色，將實驗室作為吸引和培養人才的重要基地，在建設運行期內，每年為實驗室提供不低于1300萬元的實驗室建設、日常運行、開放課題設立和人才引進培養專項經費。

實驗室依托單位溫州醫科大學需為實驗室建設提供實驗用房、科研儀器設施、科研經費等必要的基礎條件，并在人才引進和人才培養等方面給予重點支持，同時，支持實驗室探索建立符合科技創新規律的管理模式和制度，賦予實驗室主任人、財、物相對獨立的管理權限。

省部共建亞熱帶森林培育國家重點實驗室運行期間，浙江省人民政府是實驗室建設和管理的責任主體，按照省部共建、以省為主的建設和管理原則，不斷創新機制、突出地方特色，將實驗室作為吸引和培養人才的重要基地，在建設運行期內，每年為實驗室提供不低于1300萬元的實驗室建設、日常運行、開放課題設立和人才引進培養專項經費。

實驗室依托單位浙江農林大學需為實驗室建設提供實驗用房、科研儀器設施、科研經費等必要的基礎條件，并在人才引進和人才培養等方面給予重點支持，同時，支持實驗室探索建立符合科技創新規律的管理模式和制度，給予相對獨立的人事決定權。

科技部將統籌技術創新引導專項和基地人才專項等國家科技計劃支持實驗室科研能力和科研基礎條件建設。協助實驗室建立與業務對口的國家重點實驗室等高水平國家科研基地的學術交流和合作關系，提升實驗室研究能力和水平。

浙江省科技廳作為兩國家重點實驗室的主管部門，在實驗室建設運行期內，對該實驗室在省級科技計劃項目、創新團隊建設、高端人才引進與培養、科研條件建設等方面給予傾斜與支持。

兩家實驗室建設運行要依據專家論證通過的省部共建眼視光學和視覺科學國家重點實驗室建設運行實施方案(2017-2021)》、《省部共建亞熱帶森林培育國家重點實驗室建設運行實施方案(2017-2021)》開展具有區域特色的基礎研究、應用基礎研究和競爭前關鍵技術研究，提升區域科技創新能力，服務地方經濟發展。建設運行期間，實驗室應按照《省部共建國家重點實驗室管理辦法(試行)》的要求，堅持高標準建設目標，建立健全運行管理機制，加強人才隊伍培養，加強實驗條件建設，加強開放合作，不斷提升自主創新能力，努力成為區域內組織高水平科學研究、聚集和培養優秀科研人才、開展學術交流的重要基地。