《自然出版指數》(Nature Publishing　Index)雜志公布的數據顯示，美國在2013年全球科研機構排名中處于絕對領先地位，前100名中占據50個席位。在其公布的亞太地區科研機構排名中，中國科學院首次取代日本東京大學，排名亞太地區第一。哈佛大學、麻省理工學院、斯坦福大學以及美國國立衛生研究院領跑全球前200家科學研究機構。作為《自然》的增刊，《自然出版指數》是以國家和機構為單位，根據其2013年在18本《自然》和《自然》子刊上發表的研究型科研論文數量進行排名。

　　在《自然》編輯看來，許多亞太地區國家把提高科研產出量作為提升創新能力、國際競爭力和知識型經濟的基礎。報告顯示，盡管日本多年來一直主導亞太地區的科研，但亞太地區高質量的研究正在轉向中國、新加坡等國。《自然》出版集團大中華地區負責人尼克·坎貝爾認為，中國政府在基礎研究領域投入加大，使得中國在亞太地區科研機構中的排名不斷上升。

　　澳大利亞憑借地球與環境科學領域的強大優勢在亞太地區排行榜中列第3位。與2012年相比，2013年澳大利亞在每項指標上都有所提高，成為亞太地區第二大國際合作國，其科研機構對《自然》期刊的貢獻率比2012年提高了50%。亞太地區排名前200位的科研機構中，澳大利亞占29個席位，其中墨爾本大學(University　of　Melbourne)排名第8位。