中國科學家22日宣布將參與全球最大微生物基因組研究項目(Earth Microbiome Project,EMP),并承擔核心工作。該項目旨在全面、系統地研究全球范圍內的微生物群落的功能及進化多樣性,以便更好地造福人類。
與以往的微生物研究有所不同,該項目的研究對象不僅僅集中于海洋和人體環境中微生物群落,還包括土壤、空氣、淡水生態系統等整個地球表面的絕大多數的微生物群落。該項目將對來自全球的20萬個樣本進行環境DNA測序或者宏基因組測序從而建立一個全球性的基因圖譜。來自華大基因的中國科學家將會負責EMP亞洲地區所有樣本的收集和鑒定,并對整個項目提供DNA提取、擴增、建庫、宏基因組測序以及研發生物信息學分析流程所需的計算資源。這些信息學分析流程將為EMP產生的海量數據提供一個分析框架。
EMP的項目負責人、芝加哥大學和阿貢國家實驗室的教授Jack A. Gilbert博士說:“華大基因在測序能力、測序技術發展和信息分析等方面已展現出卓越的能力,EMP是一個前所未有的最大的基因組測序項目,作為全球最大基因組學研究中心的華大基因的參與是至關重要的,另外,華大基因對科學追求卓越的態度使其成為參與EMP的理想選擇。”
華大基因理事長楊煥明院士表示:“我們(華大基因)非常榮幸能夠作為主要參與者參加如此重要的研究項目。微生物對地球上所有的生命具有至關重要的作用而我們對微生物的復雜性和多樣性認識不足,征服這個未知的領域是非常有必要的。華大基因擁有國際先進水平的測序平臺和強大的生物信息學分析能力,我們相信我們可以為促進人類對微生物群落的重要性的了解貢獻出價值和力量。”
在地球上,微生物無所不在,除非最為極端的環境,它們在酸性湖泊、深海、冰凍的地方和熱泉口都能夠生存。地球上的微生物要比其他已知星球上的多,但是,迄今為止,極度缺少對地球上復雜多樣的微生物研究。然而,高通量測序技術的應用為探索微生物世界提供可前所未有的機會。與以前的微生物或微生物群體測序相比,EMP的提出將會帶來更加巨大的影響。該項目可以獲得大約500,000個重測的基因組,一個全球的代謝模型和一個所有信息可視化的數據分析入口,這將可以更好的描述每個生物群落的蛋白質空間結構及環境代謝模型。參與該項目的主要單位有華大基因(BGI)、美國阿貢國家實驗室、芝加哥大學、科羅拉多大學、勞倫斯-伯克利國立實驗室和美國基因能源聯合研究所。